حضرت آیت الله العظمی مکارم شیرازی در آغاز درس خارج فقه خود در مسجد اعظم قم با اشاره به صدور حکم اعدام آیت الله شیخ نمر و تهدید به اجرای آن از سوی سعودی ها، خاطرنشان کردند: دولتمردان عربستان سعودی یا غافل هستند یا خودشان را به غفلت زده اند، شیعیان عربستان از جمله مردم احصا و قطیف که شیعیان خالص و قوی هستند، برای برگزاری مراسم و برنامه های دینی و مذهبی خود به شدت تحت فشار هستند.
ایشان با تاکید بر این که شیعیان عربستان حق خود را می خواهند و به صورت مسالمت آمیز به دنبال آن هستند، یادآورشدند: شیخ نمر درباره احقاق حقوق مردم صحبت کرده و هیچ جرمی مرتکب نشده است؛ ایشان فردی نترس است، کدامیک از موازین اسلامی اجازه می دهد چنین آدمی را حکم اعدام برایش صادر کنند؟
معظّم له خطاب به مقامات سعودی خاطرنشان کردند: بدانید اگر این حکم اجرا شود آثار سویی برای شما خواهد داشت و تمام شیعیان دنیا کینه و بغض شدیدی نسبت به همه شما پیدا خواهند کرد.
حضرت آیت الله العظمی مکارم شیرازی تاکید کردند: شاید آنها تصور می کنند با این اقدام شیعیان و دیگر مردم می ترسند، اما این گونه نیست، آنها ابدا نمی ترسند و چنانچه این حکم اجرا شود بقیه شجاع تر خواهند شد، در زمان انقلاب ایران هر چه از انقلابیون شهید کردند مردم نه تنها صحنه را خالی نکردند بلکه پرشورتر شدند.
معظّم له ابراز داشتند: امیدواریم سر عقل بیایند و چنین برنامه ای اجرا نشود که آثارش دامن شان را خواهد گرفت و اگر اجرا شود تمام شیعیان و حتی مسلمانان معتدل دنیا نسبت به چنین کاری واکنش نشان خواهند داد.
ایشان اضافه کردند: البته مراکز جهانی نیز نسبت به این کار اعتراض کرده اند که حکومت سعودی حق اعدام ندارد، امیدواریم خداوند به همه آگاهی دهد تا منافع و مضار خود را متوجه باشیم.